Намудҳои зиёди пептидҳои трансмембранӣ мавҷуданд ва таснифоти онҳо ба хосиятҳои физикӣ ва химиявӣ, манбаъҳо, механизмҳои воридшавӣ ва барномаҳои биотиббӣ асос ёфтааст.Аз рӯи хосиятҳои физикӣ ва химиявии худ пептидҳои аз мембрана воридшавандаро ба се намуд тақсим кардан мумкин аст: катионӣ, амфифилӣ ва гидрофобӣ.Пептидҳои аз мембрана воридшавандаи катионӣ ва амфифилӣ 85%, пептидҳои аз мембрана воридшавандаи гидрофобӣ ҳамагӣ 15% -ро ташкил медиҳанд.
1.Пептиди мембранаи катионӣ
Пептидҳои трансмембрании катионӣ аз пептидҳои кӯтоҳе, ки аз аргинин, лизин ва гистидин бой мебошанд, ба монанди TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 ва DPV6 иборатанд.Дар байни онҳо, аргинин гуанидин дорад, ки метавонад гидрогенро бо гурӯҳҳои кислотаи фосфории манфӣ дар мембранаи ҳуҷайра пайваст кунад ва дар ҳолати арзиши физиологии РН пептидҳои трансмембраниро ба мембрана миёнаравӣ кунад.Тадқиқотҳои олигаргинин (аз 3 R то 12 R) нишон доданд, ки қобилияти воридшавии мембрана танҳо вақте ба даст меояд, ки миқдори аргинин то 8 кам буд ва қобилияти воридшавии мембрана бо зиёд шудани миқдори аргинин тадриҷан зиёд мешавад.Лизин, гарчанде ки аргинин катионӣ бошад ҳам, гуанидин надорад, аз ин рӯ, вақте ки он танҳо вуҷуд дорад, самаранокии воридшавии мембранаи он чандон баланд нест.Футаки ва дигарон.(2001) муайян кардааст, ки таъсири хуби воридшавии мембрана танҳо дар сурате ба даст оварда мешавад, ки пептиди мембранаи ҳуҷайраи катионӣ, ки на камтар аз 8 аминокислотаи зарядноки мусбат дошта бошад.Гарчанде ки боқимондаҳои аминокислотаҳои мусбат заряднок барои ворид шудани пептидҳои воридшаванда ба мембрана муҳиманд, дигар аминокислотаҳо ҳам яксон муҳиманд, масалан, вақте ки W14 ба F мутация мешавад, воридшавии пенетратин гум мешавад.
Синфи махсуси пептидҳои трансмембрании катионӣ пайдарпаии локализатсияи ядроӣ (NLSs) мебошанд, ки аз пептидҳои кӯтоҳи бойи аргинин, лизин ва пролин иборатанд ва метавонанд тавассути комплекси сӯрохиҳои ядроӣ ба ядро интиқол дода шаванд.NLS-ро метавон минбаъд ба як ва дугона тақсим кард, ки мутаносибан аз як ва ду кластери аминокислотаҳои асосӣ иборатанд.Масалан, PKKKRKV аз вируси simian 40 (SV40) як NLS-и ягона аст, дар ҳоле ки протеини ядроӣ NLS-и дукарата аст.KRPAATKKAGQAKKKL пайдарпаии кӯтоҳест, ки метавонад дар трансмембранаи мембрана нақш бозад.Азбаски аксари NLSҳо рақамҳои заряди камтар аз 8 доранд, NLSҳо пептидҳои трансмембрании муассир нестанд, аммо онҳо метавонанд пептидҳои трансмембрании муассир бошанд, вақте ки бо пайдарпаии пептидҳои гидрофобӣ ковалентӣ пайвастанд, то пептидҳои трансмембрании амфифилиро ташкил кунанд.
2. Пептиди трансмембрании амфифилӣ
Пептидҳои трансмембрании амфифилӣ аз доменҳои гидрофиликӣ ва гидрофобӣ иборатанд, ки онҳоро метавон ба амфифилии ибтидоӣ, амфифилии дуюмдараҷаи α-спиралӣ, амфифилии β-қатъшаванда ва амфифилии аз пролин ғанишуда тақсим кард.
Пептидҳои мембранаи фарсудаи навъи амфифилӣ ба ду категория тақсим мешаванд, категория бо NLS-ҳо бо пайдарпаии пептидҳои гидрофобӣ ба таври ковалентӣ пайваст мешаванд, ба монанди MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKRKV) ва Pep-1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV), Ҳарду дар асоси сигнализатсияи локализатсияи PSVK, ки дар нуклеарҳои гидрофобӣ дар PSVK0 асос ёфтаанд. домени MPG бо пайдарпаии синтези гликопротеини ВИЧ 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) алоқаманд аст ва домени гидрофобии Pep-1 ба кластери бойи триптофан бо наздикии мембранаи баланд (KETWWET WWTEW) алоқаманд аст.Аммо, доменҳои гидрофобии ҳарду бо сигнали локализатсияи ядроии PKKKRKV тавассути WSQP пайваст карда мешаванд.Синфи дигари пептидҳои трансмембрании амфифилии ибтидоӣ аз сафедаҳои табиӣ, ба монанди pVEC, ARF (1-22) ва BPrPr (1-28) ҷудо карда шуданд.
Пептидҳои трансмембрании амфифилии дуюмдараҷаи α-спиралӣ ба мембрана тавассути α-спиралҳо пайваст мешаванд ва боқимондаҳои аминокислотаҳои гидрофилӣ ва гидрофобии онҳо дар сатҳҳои гуногуни сохтори спирал ҷойгир шудаанд, ба монанди MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).Барои мембранаи фарсудашавии амфифилии навъи бета пептидӣ, қобилияти он барои ташаккули варақи бета плостикӣ барои қобилияти воридшавии он ба мембрана муҳим аст, масалан дар VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTVTGKGDPKPD) дар ҷараёни таҳқиқоти қобилияти воридшавии мембрана бо истифода аз намуди D - аналогҳои мутатсияи аминокислотаҳо порчаи бетаро ташкил карда натавонистанд, қобилияти воридшавии мембрана хеле заиф аст.Дар пептидҳои трансмембрании амфифилии бо пролин бойшуда, полипролин II (PPII) дар оби соф ба осонӣ ба вуҷуд меояд, вақте ки пролин дар сохтори полипептидҳо хеле бой шудааст.PPII як чархаи чапдаст бо 3,0 боқимондаҳои аминокислотаҳо дар як гардиш аст, бар хилофи сохтори стандартии алфа-спирали ростдаст бо боқимондаҳои аминокислотаҳо дар як гардиш.Пептидҳои трансмембрании амфифилии бо пролин бойшуда пептидҳои зиддимикробӣ 7(Bac7), полипептидҳои синтетикӣ (PPR)n(n метавонанд 3, 4, 5 ва 6 бошанд) ва ғ.
3. Мембранаи гидрофобии пептиди воридшаванда
Пептидҳои трансмембрании гидрофобӣ танҳо боқимондаҳои аминокислотаҳои ғайриқутбӣ доранд, ки заряди соф камтар аз 20% заряди умумии пайдарпаии аминокислотаҳо ё дорои қисмҳои гидрофобӣ ё гурӯҳҳои кимиёвӣ мебошанд, ки барои трансмембран муҳиманд.Гарчанде ки ин пептидҳои трансмембрании ҳуҷайравӣ аксар вақт нодида гирифта мешаванд, онҳо вуҷуд доранд, ба монанди омили афзоиши фибробласт (K-FGF) ва омили афзоиши фибробласт 12 (F-GF12) аз саркомаи Капоши.
Вақти фиристодан: Мар-19-2023