Схемаи лоињакашї ва мањлули занљири полипептидї

I. Хулоса
Пептидҳо макромолекулаҳои махсус мебошанд, ки пайдарпаии онҳо дар хусусиятҳои кимиёвӣ ва физикии худ ғайриоддӣ мебошанд.Баъзе пептидҳоро синтез кардан душвор аст, дар ҳоле ки дигарон синтез кардан нисбатан осон, аммо тоза кардан душвор аст.Мушкилоти амалӣ дар он аст, ки аксари пептидҳо дар маҳлулҳои обӣ каме ҳал мешаванд, аз ин рӯ ҳангоми тозакунии мо, қисми мувофиқи пептидҳои гидрофобӣ бояд дар ҳалкунандаҳои ғайриобӣ гудохта шаванд, Аз ин рӯ, ин маҳлулҳо ё буферҳо эҳтимолан бо истифодаи он ба таври ҷиддӣ номувофиқанд. тартиби таҷрибавии биологӣ, ба тавре ки техникҳо аз истифодаи пептид барои мақсадҳои худ қатъиян манъ карда шаванд, то ки дар зер якчанд ҷанбаҳои тарҳрезии пептидҳо барои тадқиқотчиён оварда шаванд.

Схемаи лоињакашї ва мањлули занљири полипептидї
Дуюм, интихоби дурусти пептидҳои мураккаби синтетикӣ
1. Дарозии умумии пайдарпаии танзимшавандаи поён
Гирифтани пептидҳои камтар аз 15 боқимонда осонтар аст, зеро андозаи пептид зиёд мешавад ва тозагии маҳсулоти хом кам мешавад.Азбаски дарозии умумии занҷири пептидҳо аз 20 боқимонда зиёд мешавад, миқдори дақиқи маҳсулот нигаронии асосӣ аст.Дар бисёре аз таҷрибаҳо, ба осонӣ ба даст овардани таъсири ғайричашмдошт тавассути паст кардани шумораи боқимондаҳо аз 20 камтар аст.
2. Шумораи боқимондаҳои гидрофобиро кам кунед
Пептидҳо бо бартарии зиёди пасмондаҳои гидрофобӣ, махсусан дар минтақа 7-12 боқимонда аз терминали C, одатан мушкилоти синтетикиро ба вуҷуд меоранд.Ин ҳамчун комбинатсияи нокифоя маҳз аз он сабаб ҳисобида мешавад, ки дар синтез варақи қабати В ба даст оварда мешавад."Дар чунин ҳолатҳо, табдил додани зиёда аз ду пасмондаҳои мусбат ва манфӣ ё гузоштани Gly ё Pro ба пептид барои кушодани таркиби пептид муфид аст."
3. Танзими пасти пасмондаҳои "мушкил"
"Як қатор боқимондаҳои Cys, Met, Arg ва Try мавҷуданд, ки одатан ба осонӣ синтез карда намешаванд."Ser одатан ҳамчун алтернативаи ғайриоксидивӣ ба Cys истифода мешавад.
Схемаи лоињакашї ва мањлули занљири полипептидї

Сеюм, беҳтар интихоби дурусти ҳалшаванда дар об
1. Нуқтаи N ё C-ро танзим кунед
Нисбат ба пептидҳои туршӣ (яъне дар pH 7 заряди манфӣ), ацетилизатсия (ацетилизатсияи N-терминус, терминали C ҳамеша гурӯҳи карбоксилҳои озодро нигоҳ медорад) барои зиёд кардани заряди манфӣ тавсия дода мешавад.Бо вуҷуди ин, барои пептидҳои асосӣ (яъне дар pH 7 заряди мусбат доранд), аминатсия (гурӯҳи аминокислотаҳо дар N-терминус ва аминатсия дар терминали C) барои зиёд кардани заряди мусбат тавсия дода мешавад.

2. пайдарпайро хеле кӯтоҳ ё дароз кунед

Баъзе аз пайдарпайҳо дорои миқдори зиёди аминокислотаҳои гидрофобӣ мебошанд, ба монанди Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr ва Ala, ва ғайра. Вақте ки ин пасмондаҳои гидрофобӣ аз 50% зиёданд, онҳо одатан ба осонӣ об намешаванд.Барои минбаъд зиёд кардани қутбҳои мусбат ва манфии пептид дароз кардани пайдарпай муфид аст.Варианти дуюм ин паст кардани андозаи занҷири пептидҳо барои зиёд кардани қутбҳои мусбат ва манфӣ тавассути коҳиш додани пасмондаҳои гидрофобӣ мебошад.Тарафҳои мусбат ва манфии занҷири пептидҳо ҳар қадар қавитар бошанд, эҳтимолияти реаксияи он бо об зиёдтар аст.
3. Ба пасмондаҳои дар об ҳалшаванда гузоред
Барои баъзе занҷирҳои пептидӣ, омезиши баъзе аминокислотаҳои мусбат ва манфӣ метавонад ҳалшавандагии обро беҳтар кунад.Ширкати мо тавсия медиҳад, ки N-terminus ё C-терминуси пептидҳои туршӣ бо Glu-Glu якҷоя карда шаванд.Терминали N ё C-и пептиди асосӣ дода шуд ва сипас Lys-Lys.Агар гурӯҳи заряднок ҷойгир карда нашавад, Ser-Gly-Ser низ метавонад дар терминали N ё C ҷойгир карда шавад.Аммо, ин равиш вақте кор намекунад, ки паҳлӯҳои занҷири пептидҳоро тағир додан ғайриимкон аст.